Hitos más importantes

A continuación enumeramos los hitos más importantes realizados a lo largo de nuestra trayectoria científica. Para ello recopilamos y analizamos toda una gran variedad de modalidades de estudios cerebrales tanto estructurales como funcionales aplicados sobre un elevado número de sujetos., de los cuales se se conocen toda una serie de variables que influyen de una forma u otra en la estructura y actividad cerebral como por ejemplo edad, sexo, diestro o zurdo, lengua materna, etc.

De forma adicional la actividad relacionada con el desarrollo de algoritmos (revisiones sistemáticas, algoritmos nuevos, etc), la creación de mapas poblacionales, la visualización de la información, bases de datos genómica y proteómica, etc, son también especialmente importantes para el buen desarrollo de nuestra Sistema Gestor del conocimiento Humano. .

Por último, tenga en cuenta que lo que se explica en los puntos siguientes es sólo un resumen para que tenga una idea lo más aproximada posible sobre nuestro proyecto. La descripción completa es accesible sólo por los usuarios que disponen de una suscripción a nuestros servicios.

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Integración de información neurofamacogenómica

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Integración de información neurofamacogenómicaSe añade a nuestra base del conocimiento una relación entre genes, enfermedades y fármacos.

El objetivo es aportar las evidencias necesarias para que se puedan elucidar los mecanismos moleculares por lo que los fármacos afectan a la función de determinados genes, y su papel en diferentes patologías.

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Integración de Ontologías proteómicas opensource a nuestra base de conocimiento

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Integración de Ontologías proteómicas opensource a nuestra base de conocimientoCompletar la información genómica con la correspondiente proteómica es imprescindible si queríamos completar nuestra base del conocimiento sobre el cerebro humano.

Partiendo de ontologías y bases de datos, describimos las funciones y relaciones de las proteinas expresadas en el cerebro humano, aportando siempre la evidencia científica que corrobora nuestros datos.

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Creación de una Base de Datos Neurogenómica

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Creación de una Base de Datos NeurogenómicaActualmente existen una gran variedad de bases de datos genómicas, aportando cada una de ellas datos que en muchos casos son contradictorios, incompletos e incluso en ocasiones erróneos. Esto es debido por un lado a la heterogeneidad de los datos, y por otro lado, tal y como sucede con la creación de las ontologías, a la generación automática de estos datos sin una posterior comprobación.

Utilizando una gran variedad de bases de datos, entre las que se encuentran las más ampliamente aceptadas por la comunidad científica, hemos recopilado los datos más relevantes de los genes que se expresan en cerebro, aportando siempre la evidencia científica del conocimiento mostrado. Con el objetivo de aportar robustez a nuestra base del conocimiento, se cotejaron los diferentes datos de forma semi-manual.

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Brain Dynamics incorpora tecnología sobre reconocimiento de movimientos

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BRAIN DYNAMICS APLICA EL RECONOCIMIENTO DEL MOVIMIENTO EN SUS APLICACIONES

Brain Dynamics, empresa EIBT (Empresa Innovadora de Base Tecnológica) dedicada al conocimiento del cerebro humano normal y patológico utilizando los últimos avances en neuroimagen y en tecnologías de la información y la comunicación (TIC).

Este nuevo uso está basado en el reconocimiento del movimiento a la hora de interactuar con las diferentes interfaces que la empresa está desarrollando.

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Estudio de la Correlación entre conectividad biológica y funcional en DTI y fMRI

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Estudio de la Correlación entre conectividad biológica y funcional en DTI y fMRI Hemos establecido de forma indirecta las conexiones existentes entre el estudio poblacional de focos de activación para cada dominio y subdominio cognitivo contemplados, y el estudio tractográfico poblacional basado en imágenes de tensor de difusión (DTI), con el objetivo de establecer un modelo poblacional de conexiones entre los distintos focos de activación, con el fin de  conocer mejor las distintas redes de conexión entre distintas zonas cerebrales para cada actividad cognitiva.

De esta forma, es posible inferir las posibles relaciones causa-efecto en las activaciones de zonas cerebrales concretas.

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Conectividad funcional en estudios de RMf en estado de reposo

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Conectividad funcional en estudios de RMf en estado de reposoBásandonos en el proyecto Connectome, que incluye más de 1200 estudios de fMRIrs (Resonancia Magnética funcional en estado de reposo), se ha seleccionado la metodología óptima para la extracción de información y su transformación en conocimiento.

Concretamente, se ha realizado un análisis “ROI-to-ROI” (ROI, región de interés) sobre RMf en estado de reposo, obteniéndose un modelo poblacional de las co-activaciones de las estructuras cerebrales, donde se incluye la probabilidad de que dos estructuras cerebrales determinadas se activen simultáneamente en reposo.

Estos datos han sido incorporados a nuestra base de datos de activaciones funcionales sobre dominios cognitivos concretos según la base de datos BrainMap, y comparadas entre sí para intentar determinar la naturaleza de estas activaciones, su relación con los dominios cognitivos clásicos.

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Clasificación de tractos en DTI

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Clasificación de tractos en DTIHemos desarrollado una serie de algoritmos con el objeto de realizar agrupación o clasificación de los tractos neuronales, procedentes de estudios de DTI (imagen por tensor de difusión).

La importancia de dicho agrupamiento de tractos radica en que podemos establecer relaciones de conectividad entre distintas zonas cerebrales, pudiendo así, una vez que se define el sentido de esa conexión, inferir la secuencia de activaciones para cada dominio cognitivo. Es decir, determinar qué "camino" recorre la información en el cerebro dada una tarea cognitiva, o  incluso deducir qué relación causa-efecto existe entre las activaciones de distintas áreas cerebrales relacionadas con distintas tareas cognitivas.

Además, dicho agrupamiento establece un atlas conectivo del cerebro, de forma que se puedan identificar tractos "anómalos", y, mediante estudios poblacionales, establecer la correlación de esos tractos anómalos con distintas patologías.

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Correlación anatómico-funcional en estudios de RMf

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Correlación anatómico-funcional en estudios de RMfSe ha realizado un meta-análisis estadístico sobre estudios RMf para inferir la correlación existente entre estructura anatómica y función cognitiva.

Mediante la realización de este estudio, ha sido posible el filtrado del importante volumen de información contenida en BrainMap,  obteniendo como resultado final una base de datos que almacena la siguiente información: (1) La probabilidad de activación de cada  estructura cerebral para cada dominio cognitivo; (2) La probabilidad de que cada dominio cognitivo se encuentre relacionado con la activación de cada estructura cerebral; y, (3) La probabilidad de que dos estructuras se activen de manera simultánea por cada dominio cognitivo.

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Estudios Longitudinales. Efectos de tratamientos farmacológicos y/o rehabilitación

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Estudios Longitudinales. Efectos de tratamientos farmacológicos y/o rehabilitaciónSe ha desarrollado una secuencia de procesado específica para estudios longitudinales, en los que se cuantifican cambios estructurales o funcionales en sujetos controlados a lo largo de un período de tiempo. Este tipo de estudios se ha convertido en un estándar a la hora de cuantificar los cambios estructurales como los explicados en el punto anterior.

Así, mediante la medida de diversos parámetros estructurales en el cerebro del mismo sujeto (con una patología dada), en diversos instantes de tiempo entre los cuales se incorporan distintos tratamientos, podemos evaluar la eficacia de los mismos  de forma objetiva, proporcionando además los datos concretos acerca de qué áreas del cerebro se ven modificadas.

Con esta evaluación, el tratamiento (farmacológico o no) obtiene una validación objetiva de su funcionamiento con respecto a la patología correspondiente

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Desarrollo de una herramienta para el soporte a la toma de decisiones en el Deterioro Cognitivo Leve

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Desarrollo de una herramienta para el soporte a la toma de decisiones en el Deterioro Cognitivo LeveEn algunos casos, es difícil diagnosticar una demencia sin datos objetivos. Es necesario desarrollar herramientas de apoyo a la toma de decisiones que, sin sustituir el criterio del especialista, le ayude en el diagnóstico presentando datos objetivos.

En este sentido hemos desarrollado una herramienta de ayuda a la toma de decisiones (basadas en datos objetivos obtenidos de un estudio centrado en casos con CDR=0.5), detectando los cambios estructurales compatibles con deterioro cognitivo leve, y cuya precisión al clasificar sujetos supera el 90%. Sin embargo, esta clasificación debe ser tomada con cautela pues es posible encontrar deterioros estructurales importantes en pacientes asintomáticos o con síntomas iniciales e inespecíficos.

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Realización de un estudio poblacional

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Realización de un estudio poblacionalSe ha realizado un estudio poblacional basado en estudios de Resonancia Magnética con el objetivo de encontrar un modelo de evolución/degeneración cerebral (tanto en sujetos normales como enfermos), que ayude al especialista en el diagnóstico precoz de enfermedades neurodegenerativas.

Dicho estudio poblacional comprende el procesado de unos 2900 cerebros, agrupados por segmentos de edad, sexo, nivel cultural, entre otros parámetros, y estará completado próximamente.

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Estudio comparativo de diversos algoritmos de registro de imágenes médicas

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Estudio comparativo de diversos algoritmos de registro de imágenes médicasBrain Dynamics, con el objetivo de utilizar las mejores técnicas y ofrecer los mejores resultados, ha realizado un estudio comparativo entre algoritmos de registro de imágenes. Este tipo de algoritmos son fundamentales a la hora de realizar estudios poblacionales, para poder comparar los datos obtenidos sobre un sujeto dado con los de un segmento de población determinado.

Entre los algoritmos más utilizados, se encuentran los trabajos de Thirion (J. Thirion. Image Matching as a Diffusion Process: an Analogy with Maxwell’s Demons. Medical ImageAnalysis, 2(3):243–260, 1998) y Vercauteren (T. Vercauteren, X. Pennec, A. Perchant, and N. Ayache. Diffeomorphic Demons: Efficient Non-parametric Image Registration. NeuroImage , Vol. 45, No. 1, Supp. 1,  2009).

Siguiendo esta línea de algoritmos, Brain Dynamics ha desarrollado una nueva implementación del algoritmo de Thirion basado en la optimización de una función de similitud entre los volúmenes. A diferencia de otros métodos, no se centra en el registro únicamente de la superficie cortical, sino que se registra el volumen completo (lo cual produce mucha más información, y más precisa, que utilizando solamente la superficie). De hecho, los resultados experimentales obtenidos por Brain Dynamics hacen pensar en que la calidad del algoritmo es, cuando menos, comparable a la de otras alternativas (como FreeSurfer, SPM...) con una serie de ventajas añadidas:

  1. No es necesario un preproceso de la corteza cerebral para disminuir las diferencias entre unos sujetos y otros.
  2. No se limita a registrar un volumen cerebral con una plantilla, sino que es posible registrar volúmenes cerebrales de dos sujetos distintos.
  3. El tiempo de ejecución es menor de 5 minutos, 10 veces más rápido que FreeSurfer y 30 veces más rápido que el paquete SPM.
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Creación de una Ontología Anatómica del Cerebro

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Creación de una Ontología Anatómica del CerebroPartiendo de ontologías anatómicas de referencia, atlas anatómicos y artículos de investigación, se ha realizado una revisión completa de la anatomía del cerebro humano, estableciendo las relaciones entre los diferentes elementos que lo componen.

La revisión manual de la jerarquía de las estructuras, las relaciones que se establecen entre ellas, y sinónimos evita las posibles ambigüedades.

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Estudio comparativo de algoritmos para la medición de la sustancia gris

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Estudio comparativo de algoritmos para la medición de la sustancia grisEl grosor de la sustancia gris es actualmente uno de los descriptores más utilizados a la hora de estudiar diversas enfermedades neurodegenerativas mediante imágenes por resonancia magnética (morfometría basada en voxel).

Brain Dynamics ha realizado un estudio comparativo de las diversas técnicas de medición de este parámetro publicadas en revistas de prestigio.

El resultado de este análisis ha confirmado que el método desarrollado por Rocha, Yezzi y Prince (K. Rocha, A. Yezzi, and J.L. Prince, A Hybrid Eulerian-Lagrangian Approach for Thickness, Correspondence, and Gridding of Annular Tissues, IEEE Transactions on Image Processing, vol.16, no.3, pp.636-648, March 2007, presenta los mejores resultados hasta la fecha.

Así, este algoritmo ha sido el seleccionado por Brain Dynamics para calcular el grosor de la Sustancia Gris cortical o interna, en sus estudios sobre estudios basados en neuroimagen sobre sujetos individuales o estudios poblacionales.

Más Artículos...

  • Creado un nuevo algoritmo de reconstrucción de la corteza cerebral
  • Desarrollo de un nuevo algoritmo de segmentación de imágenes de resonancia magnética
  • Análisis de herramientas de procesado en Neuroimagen

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